В 70-е годы на железнодорожном транспорте начинают создаваться и внедряться автоматизированные системы управления перевозочным и другими технологическими процессами и объектами. Поэтому в ЛИИЖТе в 1975-м году по решению Министерства путей сообщения создали кафедру «Теоретические основы и автоматизация управления».

С момента организации кафедра под руководством И.И. Кандаурова проводила большую научно-исследовательскую работу по управлению специальными железнодорожными перевозками. Кафедра участвовала в реформировании системы связи Прибалтийской железной дороги. Специалисты подразделения применяли свои знания и при внедрении компьютерных технологий в учебный процесс и научную дейтельность вуза.

В 1979 году на кафедре была создана лаборатория «Системы тренажа операторского персонала», которую возглавил старший научный сотрудник, к.т.н. Г.А. Красовский, а с 1992 г. — доцент А.И. Кожевников. Здесь выполнялись работы по разработке и внедрению на сети железных дорог уникальных автоматизированных систем профотбора, обучения, тренажа и аттестации оперативного персонала подразделений железнодорожного транспорта. На базе этих разработок была создана деловая игра, которая на протяжении многих лет использовалась в учебном процессе.

Научные разработки кафедры успешно эксплуатировались на станциях, в технических кабинетах, в вагонах-тренажерах на многих железных дорогах.

В 1994 г. заведующей кафедрой стала профессор, к.т.н. Н.Ф. Костянко. Выпускница ЛИИЖТа по специальности «Счетно-решающие устройства и приборы», в 1974 г. защитила кандидатскую диссертацию на тему «Структурный анализ схем в многозначной логике». Специалист в области системного анализа в информатике. Автор более 80 научных работ, лауреат конкурса «На лучшую научную книгу» в 2004 году среди преподавателей ВУЗов.

Осуществляя руководство кафедрой, Н.Ф. Костянко вела активную работу по изменению учебной и научной деятельности кафедры, вызванной повсеместным внедрением информационных технологий и систем. В связи с изменениями научной тематики кафедры в 1997 г. кафедра стала называться «Информатика и информационные технологии на транспорте».

С сентября 1998 года по октябрь 2000 года заведующим кафедрой был профессор, д.т.н. Н.А. Сапунов. Выпускник Эксплуатационного факультета ЛИИЖТа, специалист в области автоматизации работ в области управления и организации процесса перевозок, автор более 100 научных работ, среди которых особое внимание заслуживает монография «Действия оперативного персонала в нестандартных ситуациях при приеме и отправлении поездов в случае неисправности устройств». Удостоен звания «Почетный железнодорожник».

Под его руководством создана «Комплексная автоматизированная система подготовки оперативных работников хозяйства перевозок» (КАСПОР), которая внедрена на ряде железных дорог России и ближнего зарубежья, а также целый ряд программных продуктов, автоматизирующих работу оперативных работников службы перевозок.

С ноября 2000 года по апрель 2002 года заведующим кафедрой был доцент, к.т.н. Е.Н. Медведев. Специалист в области систем автоматического управления, автор более 50 научных работ, 4 авторских свидетельств, внедренных в производство. Под его руководством проводились работы по проектированию, созданию и внедрению «Автоматизированной системы ведения базы данных техническо-распорядительных актов станций», с последующим внедрением на Октябрьской ж.д.

В 2002 г. на базе существовавшей кафедры была создана кафедра, которая получила название «Информатика и информационная безопасность» (ИнИБ). Цель создания кафедры — более активное включение ПГУПС, как ведущего транспортного вуза страны, в процессы научного обоснования и решения прикладных задач информатизации и обеспечения информационной безопасности на железнодорожном транспорте и подготовка специалистов по защите информации в корпоративных информационных системах и телекоммуникационных сетях.

Заведующим кафедрой был назначен заслуженный деятель науки, профессор, д.т.н. А.А. Корниенко, широко известный специалист в области адаптивных оптических систем и защиты информации в информационно-телекоммуникационных системах космического назначения. Автор более 300 научных и научно-методических трудов, в том числе 17 монографий, учебников и учебных пособий, более 100 статей, 24 авторских свидетельств и патентов. С 2005 г. проректор по информатизации ПГУПС.

Для обеспечения высокого уровня подготовки специалистов в области информационной безопасности и защиты информации на кафедре созданы специализированные учебные лаборатории, оснащённые современным оборудованием: виртуальная криптолаборатория, лаборатория безопасных сетевых технологий, лаборатория программно-аппаратных методов и средств защиты информации, лаборатория технических методов и средств защиты информации, лаборатория технологии построения защищённых инфокоммуникационных систем, специализированные компьютерные классы современных средств и методов программирования, интеллектуальных систем.

Профессорами А.А. Корниенко и В.В. Яковлевым (кафедра ИВС) написан первый на железнодорожном транспорте учебник по тематике информационной безопасности — «Информационная безопасность и защита информации в корпоративных сетях железнодорожного транспорта» (2002 г.). Под редакцией профессора А. А. Корниенко подготовлен фундаментальный учебник в двух частях «Информационная безопасность и защита информации на железнодорожном транспорте» в издательстве «Маршрут». Часть 1 «Методология и система обеспечения информационной безопасности на железнодорожном транспорте». Выходит в 2010 году.

В последние годы учеными кафедры были разработаны требования, ставшие основой профилей защиты, и предложены комплексы средств защиты информации для системы управления пассажирскими перевозками АСУ «Экспресс-3», АСУ охраны труда, информационных систем ЦУП дорожного уровня (ЕДЦУ, ОЦ), КОТС «Миником PX-500 ЖТ», системы цифровой технологической радиосвязи стандарта GSM-R.

Разработаны проект Политики информационной безопасности и Регламент взаимодействия структурных подразделений защиты информации дорожного уровня.

Аспирантами и преподавателями кафедры активно разрабатываются интеллектуальные методы и системы обнаружения вторжений и распознавания недекларированных возможностей (НДВ). Созданы программный инструментальный комплекс с интеллектуальными свойствами «Эксперт-ОАЗИС» для распознавания НДВ в программном обеспечении, отмеченный золотой медалью премии «За укрепление безопасности России» в номинации «Инновация» (2007 г.), программный комплекс экспресс-анализа информационной безопасности программного обеспечения.

Результаты научных и учебно-методических исследований кафедры используются в ФСТЭК России, Департаменте безопасности ОАО «РЖД», на Октябрьской, Горьковской, Калининградской, Свердловской, Северо-Кавказской и других железных дорогах, в учебных заведениях России, странах СНГ и Евросоюза.