Научно-исследовательская часть является структурным научным подразделением федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Петербургский государственный университет путей сообщения Императора Александра I» и действует на основании Устава.

Научно-исследовательская часть координирует деятельность и осуществляет административное руководство работой всех подразделений, ведущих научно-исследовательские работы, организует проведение фундаментальных, поисковых и прикладных научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, а также иных видов работ, связанных с осуществлением научной деятельности Университета.

НИЧ ФГБОУ ВО ПГУПС осуществляет свою деятельность в соответствии с основными направлениями научной деятельности Университета.

В настоящее время в Университете сформировалась развернутая структура научно-исследовательского комплекса, включающая в себя научно-исследовательские институты, научно-внедренческие центры, научно-исследовательские лаборатории.