Основными направлениями научно-исследовательской деятельности на факультете являются исследования в области разработки методов управления ресурсами железной дороги (транспортной компании) в современных условиях хозяйствования и оценки инфраструктурных расходов железнодорожного транспорта, в том числе:

• анализ внешней среды функционирования транспортной компании и выявление конкурентных преимуществ компании;
• разработка мер по повышению эффективности взаимодействия железнодорожного пригородного комплекса с субъектами Российской федерации;
• анализ отраслевого рынка пригородных пассажирских перевозок и его отдельных сегментов на полигоне обслуживания компании;
• исследование путей оптимизации расходов субъектов Российской Федерации на организацию пассажирских перевозок пригородного сообщения на территории Северо-Западного федерального округа.

Перспективным направлением научной деятельности на факультете являются исследования, связанные с обоснованием и разработкой инвестиционных проектов в транспортном строительстве, в том числе:

• экономический анализ проектирования, строительства и содержания путевой инфраструктуры высокоскоростного железнодорожного транспорта;
• исследования в области управления инвестиционными и архитектурно-строительными проектами транспортных предприятий и организаций.